Universitatea A. I. Cuza Iaşi

Bioinformatică

Numele cursuluiBioinformatică CodCS3209O1
Generaţia Studii de licenţă, 2009 - 2012 Pachet 4
Nivel de studii Licenţă An 1 Semestru 2 Statut Opţional
Nr. de ore pe săptămânăNr. total de ore pe semestruNr. de ore de lucru individualCrediteMod de evaluareLimba de predare
CSLPr
2 0 2 0 56 168 8 P ro
Titularul disciplineiTitlu academic şi ştiinţific
Conferenţiar, Dr., Liviu Ciortuz
Discipline absolvite anterior
ObiectiveÎnţelegerea tehnicilor de bază folosite în analiza secvenţelor genetice
Tematica generală
  1. Noţiuni fundamentale de biologie moleculară
  2. Alinieri de perechi de secvenţe ADN/proteine
  3. Alinieri multiple de secvenţe ADN/proteine
  4. Filogenetică; modele probabiliste
  5. Modele Markov Ascunse (HMM)
  6. Alinieri de perechi de secvenţe ADN/proteine folosind HMM-pereche
  7. Alinieri multiple de secvenţe ADN/proteine folosind HMM-profil
  8. Alinieri de secvenţe ARN
  9. Identificare de motive in secvenţe genetice
Tematica seminariilor / laboratoarelorExerciţii şi probleme
Implementări pentru algoritmii predaţi la curs şi aplicaţii ale lor
Prezentări de articole recent publicate în domeniul bioinformaticii
Metode de predareSlide-uri pe video-proiector
Bibliografie
  • "Biological Sequence Analysis'', Richard Durbin, Sean Eddy, Anders Krogh, Graeme Mitchison; Cambridge University Press, 1998
  • "Problems and Solutions in Biological Sequence Analysis", Mark Borodovsky, Svetlana Ekisheva, Cambridge University Press, 2006
  • "Theory and Mathematical Methods in Bioinformatics", Shyiy Shen, Jack Tuszynski, Springer, 2008
  • "An Introduction to Bioinformatics Algorithms", Neil Jones & Pavel Pevzner; MIT Press, 2004
  • "Computational Genomics", Nello Cristianini, Matthew Hahn, Cambridge University Press, 2006.
Evaluarecondiţii
criterii
forme
formula notei finaleBaza (1 punct) + lucrare scrisă 1 (4.5 puncte)  + lucrare scrisă 2 (4.5 puncte)
© 2006-2010 FII | despre site | intranet